Si pueden estár relacionados la hipoacusia con la fistula branquial. Existe un sindrome denominado oto-branquio-renal, causado por la anomalía del GEN EYA-1. Este sindrome puede tener varias variantes, que solo afecte al oido, al cuello (fistulas) a los dos, al cuello y riñon, al riñon ya la oido...
Para definir el diagnóstico hace falta realizar un examen genético